脉图带你了解代谢组学检测分析平台
时间:2022-07-04 来源:深圳脉图 作者:小脉

代谢组学是研究个体受到环境因素刺激或外界扰动后机体代谢物变化的一门学科。代谢物的变化能够反应机体途径与表型之间的关系,探讨环境因素作用下的机体反馈调节分子机制,建立代谢通路模型,筛选有重要价值的新的分子标记物。

研究对象和代谢物的提取
常用于代谢组学研究的样本类型主要是组织、体液(血浆,尿液,唾液等)、细胞和食品等。由于生物样本的复杂性,各类代谢物具有不同的理、化性质。因此,为保证代谢物的多样性,需要结合多种提取溶剂和提取方法来从复杂基质中尽可能多的提取代谢组分。在保证小分子代谢物完整的前提下,处理的步骤越简单越好,以保证操作容易重复,也为大批样本处理节约时间。具备丰富研究经验的脉图专业研发团队经过反复研究测试,对代谢物分离方法进行了优化,可以从多种类型的生物样本中,如组织、体液(血浆、尿液、唾液等)、细胞和食品等,一次性制备和分离脂质、极性代谢物和蛋白质等大分子。这种高通量、多组学的提取手段不仅能显著减少样本和溶剂的消耗,还能大大提高分析成分的数量和质量,更易于后续数据处理和分析。

代谢组学常用的检测平台

代谢组学研究中,液相色谱质谱联用仪(LC-MS)和气相色谱质谱联用仪(GC-MS)应用最为广泛,它们速度快、灵敏度高、定性和定量能力强。GC-MS作为一种成本较低、使用简单的分析方法,可用于各种挥发性/半挥发性化合物,质谱数据稳定且可重复性强。LC-MS配合电喷雾离子源(ESI)和大气压化学源(APCI)等技术,适用的代谢物质更加广泛。GC-MS和LC-MS有各自的适用范围,在功能上高度互补,二者结合可以覆盖绝大部分的代谢物小分子。

代谢组学常用的代谢物标准品数据库

代谢物标准品数据库含有代谢物的各类信息,包括基本信息(分子式、分子量、分类、化学性质)和色谱质谱信息(保留时间、一级全扫描分子离子、加合离子信息、二级碎片信息和代谢通路信息)。常见的商品化数据库以Human Metabolome Database(HMDB), Kyoto Encyclopedia of Genes andGenomes (KEGG), MetaboliteLink (Metlin), NISTStandard Reference Database(NIST), MassBankHigh Quality Mass Spectral Database(MassBank) 等为代表。

脉图独有的代谢物标准品数据库目前包含8000多个化学标准品化合物,涵盖动植物界中的主要和基本的分子组成部分。对于每一种参比化合物,我们均采集MS/MS数据,作为MS2片段模式数据可的条目,以增强我们的结构解释能力。

脉图优势

脉图拥有LC-Orbitrap-MS和GC-TOF-MS两种高分辨质谱检测平台与世界级的代谢物标准品数据库,可以更快、更精确和更全面地鉴定样品中的代谢物。我们独家研发、整合分析不同质控数据的算法,可以最大程度反映出样品的生物性、降低检测噪音,从一份样品中检测 >5000具有高度可比性的代谢信息。

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